建所以來共取得科研成果600余項(xiàng)，成功研制出我國(guó)第一臺(tái)自行設(shè)計(jì)建造的1.2米回旋加速器，后改建為1.4米等時(shí)性回旋加速器并在其上完成新核素Pt-202的合成與鑒別，實(shí)現(xiàn)了我國(guó)在新核素合成領(lǐng)域零的突破；研制成功世界上第一臺(tái)超靈敏小型回旋加速器質(zhì)譜儀；研制生產(chǎn)出我國(guó)第一個(gè)載入國(guó)家藥典的放射性藥物。承建并運(yùn)行的上海光源是一臺(tái)高性能的中能第三代同步輻射光源，由中國(guó)科學(xué)院與上海市政府共同向國(guó)家建議和建設(shè)，于2004年底開工，按期于2009年4月竣工。上海光源是目前世界上性能最好的第三代中能同步輻射光源之一，也是我國(guó)迄今為止用戶最多的大科學(xué)裝置，是面向國(guó)內(nèi)外用戶開放的國(guó)家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施和大型科學(xué)研究平臺(tái)。迄今獲各類科技獎(jiǎng)項(xiàng)200余項(xiàng)。上海光源國(guó)家重大科學(xué)工程及其團(tuán)隊(duì)榮獲“2011年度中國(guó)科學(xué)院杰出科技成就獎(jiǎng)”、“2012年度上海市科技進(jìn)步特等獎(jiǎng)”、“2013年度國(guó)家科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)”；“重離子核反應(yīng)的集體效應(yīng)、奇異核產(chǎn)生及其性質(zhì)研究”、“重質(zhì)量豐中子新核素的合成鑒別和研究”獲國(guó)家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)；“相對(duì)論重離子碰撞中的反物質(zhì)探測(cè)和夸克物質(zhì)的強(qiáng)子譜學(xué)與集體性質(zhì)研究”和“多元、協(xié)同生物傳感界面的設(shè)計(jì)、組裝及生物分析應(yīng)用研究”同時(shí)獲2014年度上海市自然科學(xué)一等獎(jiǎng)和2016年度國(guó)家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)；“全相干自由電子激光的前沿實(shí)驗(yàn)研究與新原理探索”獲2018年度上海市自然科學(xué)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)。“上海光源國(guó)家重大科學(xué)工程”、“突破釷基核能系統(tǒng)核心技術(shù)，建成原型系統(tǒng)”入選中科院“十二五”重大科技成果及標(biāo)志性進(jìn)展。“合成新核素鉑-202”、“發(fā)現(xiàn)反氦核”、“建成上海光源”和“釷基熔鹽堆核能系統(tǒng)研發(fā)”等四個(gè)成果入選“中國(guó)科學(xué)院改革開放40年40項(xiàng)標(biāo)志性科技成果”。